SARS-CoV-2

教材としての新型コロナウイルス情報サイト

2023.1．3更新

はじめに
　2019年末から世界的に感染が拡大したCOVID-19ですが、いまだに終息の兆しが見えていません。原因となる新型コロナウイルスSARS-CoV-2やそれに対するワクチンや治療薬に関する情報は非常に多いのですが、高校生や大学生に「正しい知識」が十分に伝わっていないのが現状と言えます。高校や大学での授業で取り扱うことは、感染拡大の防止にもつながることになります。2021年５月４日にＴ＆Ｄ（番外編）「教材としての新型コロナウイルス」意見交換会を行いましたが、「こんな情報が載っているWebサイトがあるよ」という話題も出ました。そこで、紹介されたWebサイトを軸に他のサイトも加えて、リストを作成しました。
　「生物」の授業等の教材作成に特化したものなので、感染者数の情報やワクチン接種方法、政府や自治体の対応などに関する情報はありませんのでご了承下さい。

　Ｔ＆Ｄ（番外編）「教材としての新型コロナウイルス」意見交換会・中道資料(pptx)
　生物の授業のどこで新型コロナウイルスを取り扱うのか（pptx　西郷作成）
　マスクの効果と・飛沫シミュレーション（pptx　西郷作成2022年改定）

　2021.10.3に　Ｔ＆Ｄ（番外編）「コロナ禍の生物教育」意見交換会を行いました。
　Ｔ＆Ｄ（番外編）2021.10.3「コロナ禍の生物教育」意見交換会・中道報告(pptx)

情報量が多くなったので、各項目ごとに有用と思われるものを絞り込んでこの頁に掲載しました。他の情報は各項目ごとの追加情報ページに移行しました。（2022．1西郷）

情報を次のように区分しました。
　１．COVID-19関連情報全般
　２．新型コロナウイルスSARS-CoV-2の構造
　３．ゲノムとタンパク質
　４．ウイルスの侵入過程
　５．スパイクタンパク質とACE2の結合関連
　６．侵入後の細胞内での複製・タンパク質合成
　７．変異株
　８．検査方法　PCR法・抗体検査・抗原検査
　９．新型コロナウイルスと免疫反応
　 10．ワクチン
　１1．治療法
　１2．感染防止関係
　
なお、リスト中の［Ｎ］［Ｉ］などは、情報の紹介者を示します。
　　　［Ｎ］中道貞子　［Ｉ］伊藤政夫　［Ｓ］西郷孝　［Ｋ］片山舒康　［Ｕ］薄井芳奈　［Ｈ］半本秀　[Y]博吉川靖浩　
注）リンク先が複数行になっているものはまるごとコピーしてブラウザのURL欄に入れてください。（とりあえず、リンク先に飛べるようにしてありますが・・・）
★：最新の掲載（掲載後しばらくの間付加する）

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１．COVID-19関連情報全般　［追加情報はこちら］
　１．新型コロナウイルス感染症（COVID-19）関連情報について
　　　国立感染症研究所NIID(National Institute of Infectious Diseases)
　　　https://www.niid.go.jp/niid/ja/diseases/ka/corona-virus/2019-ncov/9324-2019-ncov.html
　２．コロナウイルスとは
　　　コロナウイルス全般に関する解説　国立感染症研究所
　　　https://www.niid.go.jp/niid/ja/kansennohanashi/9303-coronavirus.html
　３．山中伸弥による新型コロナウイルス情報発信
　　　https://www.covid19-yamanaka.com/
　４．山中氏の紹介する癌研究者・黒木登志夫氏の解説
　　　https://www.covid19-yamanaka.com/cont2/46.html

２．新型コロナウイルスSARS-CoV-2の構造　［追加情報はこちら］
　１．コロナウイルスの概略図（Jibe Cui et al. 2020から引用）［Ｎ］
　　　新型コロナウイルスの感染と免疫の仕組みにつき解読（2020.2.17）
　　　サイヤジェン株式会社(Cyagen Biosciences (Japan) Inc.) は医薬品開発関連企業
　　　https://www.cyagen.jp/community/newsletters/issue-2020-02-17.html

３．ゲノムとタンパク質　　［追加情報はこちら］
　１．NCBI SARS-CoV-2 Resources［Ｎ］
　　　NCBI（National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of
　　　Medicine）のデータペース
　　　https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sars-cov-2/
　２．Full genome sequence of SARS-Cov-2［Ｎ］
　　　Observation Island　第一三共株式会社所属の大島康雄氏（内科医）ブログ
　　　（所属はブログの記載）　全ゲノム配列と、説明あり
　　　　https://plaza.umin.ac.jp/~OIO/blog/2020/05/23/full-genome-sequence-of-sars-cov-2/
　３．そもそもウイルスってどんなものでしたっけ？
　　　ウイルスのゲノムによる分類　日経メディカル
　　　https://medical.nikkeibp.co.jp/leaf/all/report/t344/202003/564951.html
　４．SARS-CoV-2 RNA依存性 RNAポリメラーゼの分子基盤
　　　理化学研究所関根俊一　SAR News No.40 (Apr. 2021)
　　　RNA依存性 RNAポリメラーゼ、エキソヌクレアーゼ、RNAヘリカーゼなどの解説あり
　　　https://sar.pharm.or.jp/wp-content/uploads/2021/04/SAR-News-No40.pdf

４．ウイルスの侵入過程　　［追加情報はこちら］
　１．SARS-CoV-2 (Covid-19) Infection Process　［Ｕ］
　　　感染プロセスのアニメーション　（2020/05/07）
　　　https://www.youtube.com/watch?v=SvA1s5S9rQ0
　２．新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の開裂活性化と細胞侵入（図2）［Ｎ］
　　　日本病態プロテアーゼ学会　「新型コロナウイルスSARS-CoV-2の宿主プロテアーゼ
　　　による開裂活性化　国立感染症研究所」竹田誠
　　　http://jspp.kenkyuukai.jp/special/index.asp?id=33578
　３．ACE2とスパイクタンパク質の結合後にFurinによるスパイクタンパク質の
　　　　切断（S1/S2）が起き、宿主細胞に突き刺さるようになり、侵入が始まる。［Ｓ］
　　　SARS-CoV-2 S protein:ACE2 interaction reveals novel allosteric targets
　　　https://elifesciences.org/articles/63646

５．スパイクタンパク質とACE2の結合関連　　［追加情報はこちら］
　１．S protein of SARS-CoV-2［Ｓ］［Ｎ］
　　　立体構造を見ることができます。501番目のN（アスパラギン）も確認できる。
　　　https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/icn3d/full.html?mmdbid=7C2L&command=view
　２．COVID-19原因ウイルスのspike蛋白質の受容体結合ドメインとヒトACE2［Ｎ］
　　　Observation Island　第一三共株式会社所属の大島康雄氏（内科医）ブログ
　　　（所属はブログの記載）　　結合の様子を示すシミュレーション動画あり
　　　https://plaza.umin.ac.jp/~OIO/blog/2020/04/11/covid19%e3%81%aespike%e8%9b%8b%

６．侵入後の細胞内での複製・タンパク質合成　［追加情報はこちら］
　１．コロナウイルスの構造と複製サイクル（ライフサイクル）［Ｎ］
　　　城西国際大学　薬学部　額賀路嘉
　　　https://www.jiu.ac.jp/features/detail/id=6822
　２．What happens in your body when you contract the Coronavirus?
　　　（日本語字幕あり）［Ｎ］
　　　https://www.youtube.com/watch?v=5DGwOJXSxqg
　３．SARS-CoV-2 - part 2 - From the viral genome to protein structures　［Ｓ］
　　　PETER SCHMIDTKE　MARCH 27, 2020
　　　https://www.discngine.com/blog/2020/3/27/sars-cov-2-2-from-the-viral-genome-
　　　towards-protein-structures

７．変異株　［追加情報はこちら］
　１．新型コロナウイルス変異株とは［Ｓ］
　　　日本医学臨床検査研究所のホームページ。変異株全般についての説明。
　　　https://www.jcl.co.jp/covheni
　２．スパイクタンパク質とACE2・抗体の結合状態の立体構造［Ｓ］
　　　Cryo-electron microscopy structures of the N501Y SARS-CoV-2 spike protein
　　　in complex with ACE2 and 2 potent neutralizing antibodies
　　　PLOS Biology 　Research Article | published 29 Apr 2021
　　　https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3001237
　　　https://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.3001237
　３．SARS-CoV-2 変異［Ｓ］
　　　Observation Island　第一三共株式会社所属の大島康雄氏（内科医）ブログ
　　　（所属はブログの記載）
　　　https://plaza.umin.ac.jp/~OIO/blog/2021/05/08/sars-cov-2-%e5%a4%89%e7%95%b0/
　４．変異株の系統樹［Ｓ］
　　　ミュー株より前の系統を図示したもの
　　　VOLVING THREAT－New variants have changed the face of the pandemic.
　　　What will the virus do next?
　　　　https://www.science.org/content/article/new-sars-cov-2-variants-have-changed-pandemic-what-will-virus-do-next
　５．各変異株の詳細［Ｓ］
　　　各変異株について、具体的にどこが変異しているかが分かるサイト
　　　https://outbreak.info/situation-reports#voc

８．検査方法　PCR法・抗体検査・抗原検査　［追加情報はこちら］
　１．新型コロナウイルス感染症に関する検査について［Ｓ］
　　　厚生労働省ホームページ　政策について・「健康・医療」
　　　https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/0000121431_00132.htmll
　２．ＰＣＲ検査、抗原検査、抗体検査の違いは？［Ｓ］
　　　メディカル・ビー・コネクト株式会社
　　　https://www.medical-bc.co.jp/news/information/pcr-check-etc-diference
　　　-covid-19-antibody-testing.php
　３．★新型コロナ抗体保有率調査（2022.12）
　　　厚生労働省・国立感染症研究所
　　　全都道府県を対象に、献血時の検査用検体の残余血液を用いて、2022年11月
　　　6日〜11月13日における献血者8260人の抗N抗体保有割合を調査した。
　　　https://www.niid.go.jp/niid/images/epi/corona/82/covid19-82.pdf
　４．★新型コロナウイルスの無症状感染の動向
　　　政府の行った調査を自治医大の研究グループがその一部をまとめたもの。
　　　無症状者1,082,976人を対象に唾液をサンプルとした。
　　　https://www.jichi.ac.jp/wp/wp-content/uploads/2022/12/20221228.pdf

９．新型コロナウイルスと免疫反応　　［追加情報はこちら］
　１．ウイルスに対する免疫応答の仕組み（１）
　　　ウイルス・再生医科学研究所　河本　宏　2020年5月9日（2021年2月8日更新）
　　　ウイルス侵入後に起こる免疫反応を解説
　　　国立研究開発法人　日本医療研究開発機構　創薬支援推進事業
　　　https://www.covid19-taskforce.jp/opened/immune-response1/
　２．新型コロナウイルスに殺傷効果を持つ記憶免疫キラーT細胞　［Ｓ］
　　　世界各国の感染状況に比べると日本での感染の規模は小さい。山中伸弥氏は
　　　この要因を「ファクターＸ」としている。理化学研究所が発表した　HLA-A24　が
　　　この一つかもしれない。
　　　https://www.riken.jp/press/2021/20211208_1/

１0．治療法　　［追加情報はこちら］
　１．COVID-19の経口治療薬　［Ｓ］
　　　東京都医学総合研究所のホームページ
　　　Pfizer社製の経口薬｢パクスロビド｣、Merck社製の「モルヌピラビル」についての解説
　　　https://www.igakuken.or.jp/r-info/covid-19-info91.html
　２．抗体カクテル療法とは［Ｓ］
　　　神奈川県健康医療局医療危機対策本部室のページの　簡単な解説図
　　　https://www.pref.kanagawa.jp/docs/ga4/covid19/about/regn-cov2.html
　３．★シオノギ製薬ゾコーバの作用機序
　　　ゾコーバについての説明（塩野義製薬）
　　　https://www.shionogi.co.jp/med/products/drug_sa/xocova-att/XCV-DC-0002.pdf

１1．ワクチン　　［追加情報はこちら］
　１．ワクチンとは？　［Ｓ］
　　　国際メディアサービスシステム研究所代表　廣谷　徹　2020年11月30日
　　　各種ワクチンの紹介など
　　　https://blog.goo.ne.jp/imssr_media_2015/e/9873c1e499243e3b6b4ef9786082d99d
　２．COVID-19 mRNAワクチンが働くしくみ［Ｎ］
　　　Snohomish Health District
　　　https://www.snohd.org/ImageRepository/Document?documentId=6074
　３．mRNAワクチン開発史［Ｓ］
　　　The tangled history of mRNA vaccines　開発には多くの研究者が関わっている
　　　Nature．Vol 597 pp.318～324．16 September 2021
　　　https://www.nature.com/articles/d41586-021-02483-w

１２．感染防止関係　　　［追加情報はこちら］
　1．飛沫やエアロゾルの飛散の様子を可視化し有効な感染対策を提案　
　　　～「富岳」による新型コロナウイルス対策その1［Ｓ］
　　　https://www.r-ccs.riken.jp/highlights/pickup2/
　２．エタノールの除菌効果［Ｎ］
　　　日本食品洗浄剤衛生協会（食洗協）
　　　エタノールの最適除菌濃度、エタノールの食中毒菌やウイルスへの作用の
　　　強さについての記述あり。
　　　http://shokusen.jp/ethanol.html
　３．★エスカレーターでの飛沫シミュレーション
　　　　YouTube　朝日新聞デジタル
　　　https://www.youtube.com/watch?v=Kku2348tONw
　４．★第八波にむけた感染拡大抑止のための「富岳」飛沫シミュレーション
　　　東京都新型コロナウイルス感染症モニタリング会議資料
　　　（第108回）（令和4年12月1日）　マスクの効果、小規模店舗におけるリスク
　　　低減対策、公共交通機関におけるリスク低減対策（観光バス）、
　　　宴会場におけるリスク低減対策　等の資料。
　　　動画（Youtube）　https://tokyodouga.jp/qcopsebmw6s.html